最初のタイムシェアリングOSのCTSS
マッカーシーと電気工学部助教授のティーガーが、IBM 709をコルバトが改造した3台のFlexowriterで同時に利用できるソフトウェアの開発に着手し、61年11月に4台の端末で利用できることを実演した。ティーガーは割り込みを利用して、実行中のプログラムを中断して磁気テープ装置に移動させ、他のプログラムを処理した後でメモリに復帰させる初歩的なOSを記述した。このOSはMIT計算センターのIBM 709のバッチ処理に影響することなく、TSSによる対話型処理を可能にし、CTSS（Compatible Time-Sharing System、互換タイムシェアリング・システム）と名づけられた。
ティーガーは、多数の同時ユーザをサポートするには処理能力の向上が必要と考え、IBM 704の30倍以上の性能をもつIBM 7030（STRETCH）の購入を求めた。このマシンは大学には高価過ぎ、ティーガーのOSもごく初歩的だったので、研究グループは提案に反対した。ティーガーはプロジェクトを離れ、マッカーシーがプロジェクトリーダーに選出された。しかし、マッカーシーも人工知能研究に専念することを望み、62年9月にスタンフォード大学に移籍する道を選んだ。
コルバトは 62年に准教授に昇進し、TSSの開発責任者になった。モースが米国科学財団の支援を取り付け、コルバトは62年春に利用可能になった最初のトランジスタ・コンピュータIBM 7090で、CTSSの開発に取り組むことになった。このマシンはIBM 709とほぼ同じシステムで処理能力が6倍あり、OS専用のメモリを特別に追加していた。
コルバトは、マージョリー・マーウィン・ダゲット、ロバート・ディリー、ロバート・クリーシーとともに、後にUnixの特色となる階層型ファイルシステムの開発に取り組んだ。かれらは、この過程でメモリ内プログラムの保護、タイムスタンプ、パスワード、更新済みファイルを探索してバックアップするデーモンなどを開発した。
CTSSは、ユーザ・コマンドの解釈、ディスクの読み書き、ユーザ・プログラムの利用状況の監視と実行プログラムの切り替え、ディレクトリなどOSの中枢機能だけを担い、その上層で様々なコマンドを追加開発できた。コルバトは、CTSSを新しく導入するユーザは必要に応じて自分自身のCTSSに改造できるというオープンシステムの考え方をもち、今日のマイクロカーネルに相当するOSを初めて開発した。
CTSSは62年11月に、16台の端末でIBM 7090を同時に利用できることを示し、ARPA〔Advanced Research Projects Agency、高等研究計画局、のちの国防総省高等研究計画局（DARPA）〕のJ.C.R.リックライダーにMITの実力を印象づけた。
プロジェクトMACとオンライン開発環境
リックライダーは62年10月にARPAに着任し、年間1,000万ドルの予算でTSSを相互接続する汎用的なネットワークの構想を現実に近づけるべく活動を開始した。かれはまず11月に、600万ドルの予算が割り当てられていたSDCを、マッカーシーとコルバトとともに訪れ、SDC（System Development Corporation、世界最初のソフトウェア開発会社）が保守を担当しているSAGEのコンピュータのスペアマシンAN/FSQ-32で、TSSを実現するよう説得した。かれは次いで、MITのファノにARPAが支援する情報ユーティリティのパイロットシステムのプロジェクト・リーダーになって若手研究者のまとめ役になるよう示唆した。
ファノはイタリアから亡命した電気工学の教授で、戦後にクロード・シャノンの情報理論の研究者となり、コンピュータと人工知能の当時の状況に通じていた。かれは、リックライダーの勧めに応じて11月26日に2頁の提案書をMIT上層部に届け、翌日に学長のジュリアス・ストラトンにモースとともに面会した。ストラトンは、巨大なコンピュータを要するプロジェクトをどこで始めるのか尋ねた。ファノは、キャンパスの北隣にある545メインストリート（現200テクノロジー・スクウェア）にある9階建てのビルの8階と9階が空いていることを話すと、ストラトンは同意した。
ファノは63年1月にプロジェクトをARPAに正式に提案し、2ヶ月後に年間300万ドルの助成を獲得しプロジェクトをMAC（Multiple Access Computer／Machine Aided Cognition）と命名した。ファノはこの名称により、TSSのグループと人工知能グループの研究を共通の頭文字で表現し、ARPA支援の1つのプロジェクトとして資源を共有させた。リックライダーは63年7月に、このビルにARPAの支援を望む研究者を集めた研究会を開催し、コルバトは参加者にTSSの講義とCTSSを体験させる役割を担当した。
コルバトは63年10月にプロジェクトMAC専用のIBM 7094 IIを受け取り、1週間でCTSSを移植した。このマシンもOS専用のメモリを装備した特別仕様で、36ビット×32kワードのメモリを128ブロックに分割してユーザに割り当てることができた。1,200bpsのモデムでCTSSにダイアルアップ接続でき、プログラマは様々な場所から開発プロジェクトに参加できる。
このオンライン環境は当時としては画期的で、サルツァーが開発した電子写植用コマンドのTYPSETとRUNOFFによるワープロ、トム・ヴァン・ヴレクのMAILコマンドによるユーザ間電子メール、アレン・シャーのファイルをまとめて圧縮できるARCHIVEユーティリティが開発され、プログラマによるコラボレーションを可能にした。
